Projekt na podporu efektivní finanční správy je zaměřen na výkon primární funkce SFÚ, kterou představuje správa daňových příjmů. Projektové aktivity jsou orientovány na:
1. zvýšení efektivnosti a výtěžnosti správy daní, včetně snížení časových nároků na její provádění,
2. racionalizaci dosavadních procesů a standardizaci pracovních úkonů,
3. posílení pozice instituce veřejné správy ve vztahu k zástupcům soukromého sektoru.
Projekt přispívá k odklonu od formálně procesního zajištění správy daní a od represivních postupů správce daně k nové formě spolupráce a komunikace s daňovými subjekty. Požadovaným výstupem projektu SFÚ je moderní systém využívající inovativní nástroje k efektivnímu výkonu finanční správy, podporující rozvoj a motivaci zaměstnanců, kteří jsou schopni využívat nové implementované nástroje správy daní na SFÚ, aplikovat nové poznatky a dovednosti do standardních pracovních postupů. Souhrn těchto prvků směřuje k posílení významu a postavení SFÚ, jeho institucionální kapacity a k efektivní, hospodárné a účelné správě daní s pozitivními fiskálními dopady.